Mário Afonso estudou na Escola de Artes Visuais António Arroio. Entre 1991/1995 foi bolseiro na escola Pro.Dança e entre 1995/1998 concluiu a licenciatura em Dance Theatre Performance na EDDC-HKA (European Dance Development Centre/Hogeschool voor de Kunsten – Arnhem), na Holanda.
Desde 1998 tem vindo a desenvolver um trabalho autoral com apresentação pública, desde 1999, em Portugal, Espanha, Holanda e Bélgica. Paralelamente ao desenvolvimento do seu trabalho de criação artística Mário Afonso tem participado e realizado workshops, seminários e outros eventos na vasta área do fazer e do pensar, além de estudos académicos.
Em 2009 fundou a associação cultural Carta Branca.