João Pacheco começou e concluiu os primeiros estudos musicais em Lagos, interessando-se inicialmente pelo saxofone, mas decidindo terminar o curso secundário na variante de composição com Helena Rita, juntamente com o 8º grau de piano, com o acompanhamento de João Rosa. De seguida, ingressou na Escola Superior de Música de Lisboa, onde agora frequenta o Mestrado em Ensino de Música, tendo trabalhado com João Madureira, Sérgio Azevedo, Luís Tinoco e Carlos Caires, e participado em conferências com Kaija Saariaho e Luigi Abate, entre outros.
Como compositor, tem participado em vários projetos multidisciplinares que incluem campos como a composição coreográfica, o vídeo, a ilustração e o teatro de sombras, tendo vindo a apresentá-los na região do Algarve e em Lisboa. Recentemente, venceu o segundo Prémio de Composição SPA / Antena 2.
Em 2023, Pacheco é um dos convidados a integrar o programa Jovens Compositores nos EVC.